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Gianluca Frustagli
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Gianluca Frustagli Aggiunta testo sulle modalità di richiesta servizio.
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 **Area Proteomica**
-====== Reverse Phase Protein μArrays (RPPA) ======
+====== Reverse-Phase Protein microArrays (RPPA) ======
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   * [[:aree:proteomica:rppa:richiesta|Richiesta servizio]]
   * [[:aree:proteomica:rppa:protocolli|Protocolli]]
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   * [[:aree:proteomica:rppa:link_tutorial|Link & Tutorial]]
   * [[:aree:proteomica:rppa:faq|FAQ]]
-</wrap>
+</WRAP>
-{{:aree:proteomica:rppa:rppa-lab.jpeg?300 |Laboratorio RPPA}} La tecnologia dei Reverse-Phase Protein μArrays (RPPA) è una piattaforma di analisi molecolare basata sull’utilizzo di anticorpi specifici e sfrutta i principi dell’amplificazione del segnale utilizzati nella diagnostica clinica, per misurare i livelli di centinaia di proteine e le loro modificazioni post-traduzionali (e.g. fosfo-proteine) su un numero elevato di estratti proteici((Mueller C, Liotta LA, Espina V. Reverse phase protein microarrays advance to use in clinical trials. Mol Oncol. 2010 Dec;4(6):461-81. doi: 10.1016/j.molonc.2010.09.003. Epub 2010 Oct 16.))((Wulfkuhle JD et al. Technology insight: pharmacoproteomics for cancer--promises of patient-tailored medicine using protein microarrays. Nat Clin Pract Oncol. 2006 May;3(5):256-68.))((Gallagher RI, Espina V. Reverse phase protein arrays: mapping the path towards personalized medicine. Mol Diagn Ther. 2014 Dec;18(6):619-30. doi: 10.1007/s40291-014-0122-3.)). Questa tecnologia permette di utilizzare campioni di varia natura: porzioni di tessuto tumorale, liquidi biologici come ad esempio siero o liquido cefalorachidiano e cellule tumorali derivate da pazienti e coltivate in vitro((Locard-Paulet M et al. Phosphoproteomic analysis of interacting tumor and endothelial cells identifies regulatory mechanisms of transendothelial migration. Sci Signal. 2016 Feb 9;9(414):ra15. doi: 10.1126/scisignal.aac5820.))((Santacatterina F et al. Quantitative analysis of proteins of metabolism by reverse phase protein microarrays identifies potential biomarkers of rare neuromuscular diseases. J Transl Med. 2015 Feb 18;13:65. doi: 10.1186/s12967-015-0424-1.))((Gujral TS et al. Profiling phospho-signaling networks in breast cancer using reverse-phase protein arrays. Oncogene. 2013 Jul 18;32(29):3470-6. doi: 10.1038/onc.2012.378. Epub 2012 Sep 3.))((Akbani R et al. A pan-cancer proteomic perspective on The Cancer Genome Atlas. Nat Commun. 2014 May 29;5:3887. doi: 10.1038/ncomms4887.)).
+{{:aree:proteomica:rppa:rppa-lab.jpeg?300 |Laboratorio RPPA}} La tecnologia dei Reverse-Phase Protein microArrays (RPPA) è una piattaforma di analisi molecolare basata sull’utilizzo di anticorpi specifici e sfrutta i principi dell’amplificazione del segnale utilizzati nella diagnostica clinica, per misurare i livelli di centinaia di proteine e le loro modificazioni post-traduzionali (e.g. fosfo-proteine) su un numero elevato di estratti proteici((Mueller C, Liotta LA, Espina V. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20974554|Reverse phase protein microarrays advance to use in clinical trials.]] Mol Oncol. 2010 Dec;4(6):461-81. doi: 10.1016/j.molonc.2010.09.003. Epub 2010 Oct 16.))((Wulfkuhle JD et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16683004|Technology insight: pharmacoproteomics for cancer--promises of patient-tailored medicine using protein microarrays.]] Nat Clin Pract Oncol. 2006 May;3(5):256-68.))((Gallagher RI, Espina V. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25358623|Reverse phase protein arrays: mapping the path towards personalized medicine.]] Mol Diagn Ther. 2014 Dec;18(6):619-30. doi: 10.1007/s40291-014-0122-3.)). Questa tecnologia permette di utilizzare campioni di varia natura: porzioni di tessuto tumorale, liquidi biologici come ad esempio siero o liquido cefalorachidiano e cellule tumorali derivate da pazienti e coltivate in vitro((Locard-Paulet M et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26861043|Phosphoproteomic analysis of interacting tumor and endothelial cells identifies regulatory mechanisms of transendothelial migration.]] Sci Signal. 2016 Feb 9;9(414):ra15. doi: 10.1126/scisignal.aac5820.))((Santacatterina F et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25880557|Quantitative analysis of proteins of metabolism by reverse phase protein microarrays identifies potential biomarkers of rare neuromuscular diseases.]] J Transl Med. 2015 Feb 18;13:65. doi: 10.1186/s12967-015-0424-1.))((Gujral TS et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22945653|Profiling phospho-signaling networks in breast cancer using reverse-phase protein arrays.]] Oncogene. 2013 Jul 18;32(29):3470-6. doi: 10.1038/onc.2012.378. Epub 2012 Sep 3.))((Akbani R et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24871328|A pan-cancer proteomic perspective on The Cancer Genome Atlas.]] Nat Commun. 2014 May 29;5:3887. doi: 10.1038/ncomms4887.)).
 L’unità ha acquisito esperienza specifica in campo oncologico e in particolare:
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 Un'applicazione innovativa è il riposizionamento, in diversi ambiti terapeutici, di farmaci approvati studiandone gli effetti sulle reti di trasduzione del segnale.
-La strumentazione avanzata dell'unità comprende: un microdissettore a laser infrarosso per isolare specifiche porzioni di tessuto, un arrayer robotico per la microdeposizione dei campioni proteici su vetrini ricoperti da nitrocellulosa, un Autostainer per effettuare le immunocolorazioni e l'amplificazione del segnale in modo automatizzato, uno scanner a fluorescenza per digitalizzare i vetrini immunocolorati e una piattaforma software per l'analisi di immagine che consente la quantificazione e la normalizzazione del segnale. Questa dotazione rende l'unità di RPPA unica in Italia. Inoltre, in {{validated_antibodies-rppa-iss.xlsx |Tabella 1}} è riassunto il numero di anticorpi validati per più di 20 vie di trasduzione del segnale per un totale di circa 400 anticorpi validati, la maggior parte diretti contro proteine fosforilate o altre modifiche post-traduzionali. Nuovi anticorpi vengono validati, di volta in volta, e aggiunti alla banca a seconda delle diverse esigenze progettuali.
+La strumentazione avanzata dell'unità comprende: un microdissettore a laser infrarosso per isolare specifiche porzioni di tessuto, un arrayer robotico per la microdeposizione dei campioni proteici su vetrini ricoperti da nitrocellulosa, un Autostainer per effettuare le immunocolorazioni e l'amplificazione del segnale in modo automatizzato, uno scanner a fluorescenza per digitalizzare i vetrini immunocolorati e una piattaforma software per l'analisi di immagine che consente la quantificazione e la normalizzazione del segnale. <wrap hi>Questa dotazione rende l'unità di RPPA unica in Italia</wrap>. Inoltre, in __{{:aree:proteomica:rppa:pathway_anticorpi-rppa-iss.xlsx|Tabella 1}}__ è riassunto il numero di anticorpi validati per più di 20 vie di trasduzione del segnale per un totale di circa __{{:aree:proteomica:rppa:validated_antibodies-rppa-iss.xlsx|400 anticorpi validati}}__, la maggior parte diretti contro proteine fosforilate o altre modifiche post-traduzionali. Nuovi anticorpi vengono validati, di volta in volta, e aggiunti alla banca a seconda delle diverse esigenze progettuali.
 L'unità di RPPA collabora con l'Istituto Nazionale Tumori di Milano, l'Istituto Nazionale Tumori Regina Elena, l'Università degli Studi di Roma "Tor Vergata", l'Università Cattolica del Sacro Cuore e l'Università degli Studi di Palermo.
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 L'unità fornisce eventuale supporto tecnico-scientifico per l'estrazione delle proteine, la scelta mirata degli anticorpi da studiare e l'analisi statistico/bioinformatica dei dati normalizzati.
-Per accedere al servizio è necessario compilare il modulo on-line [[aree:proteomica:rppa:richiesta|Richiesta Servizio]]. Sarete contattati per un incontro preliminare.
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+=== Per accedere al servizio è necessario: ===
+  - contattare preliminarmente il [[chi_siamo|personale dell'unità RPPA]];
+  - compilare il modulo online '**[[richiesta|Richiesta Servizio]]**' illustrando brevemente la problematica scientifica, tipologia e numero di campioni, etc.;
+  - verrà quindi fissato un incontro con il personale dell'unità per discutere le modalità di analisi, i costi, la tempistica etc.
+\\
 > Contatto: [[michele.signore@iss.it|Michele Signore]]
-> Tel.: **06 4990 4453**
+> ☎ **+39 06 4990 4453**
-> Dove siamo: **GB BS, stanza 7**
+> Dove siamo: **GB-BS, stanza 7**