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Gianluca Frustagli Aggiunta testo sulle modalità di richiesta servizio.
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 **Area Proteomica**
-====== LC-MS/MS ======
+====== Reverse-Phase Protein microArrays (RPPA) ======
-<wrap button>[[:aree:proteomica:lc-ms_ms:richiesta|Richiesta servizio]] [[:aree:proteomica:lc-ms_ms:protocolli|Protocolli]] [[:aree:proteomica:lc-ms_ms:bibliografia|Bibliografia]] [[:aree:proteomica:lc-ms_ms:faq|FAQ]]</wrap>
+<WRAP tabs>
+  * [[:aree:proteomica:rppa:richiesta|Richiesta servizio]]
+  * [[:aree:proteomica:rppa:protocolli|Protocolli]]
+  * [[:aree:proteomica:rppa:bibliografia|Bibliografia]]
+  * [[:aree:proteomica:rppa:link_tutorial|Link & Tutorial]]
+  * [[:aree:proteomica:rppa:faq|FAQ]]
+</WRAP>
-===== Descrizione tecnologia e applicazioni sperimentali =====
+{{:aree:proteomica:rppa:rppa-lab.jpeg?300 |Laboratorio RPPA}} La tecnologia dei Reverse-Phase Protein microArrays (RPPA) è una piattaforma di analisi molecolare basata sull’utilizzo di anticorpi specifici e sfrutta i principi dell’amplificazione del segnale utilizzati nella diagnostica clinica, per misurare i livelli di centinaia di proteine e le loro modificazioni post-traduzionali (e.g. fosfo-proteine) su un numero elevato di estratti proteici((Mueller C, Liotta LA, Espina V. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20974554|Reverse phase protein microarrays advance to use in clinical trials.]] Mol Oncol. 2010 Dec;4(6):461-81. doi: 10.1016/j.molonc.2010.09.003. Epub 2010 Oct 16.))((Wulfkuhle JD et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16683004|Technology insight: pharmacoproteomics for cancer--promises of patient-tailored medicine using protein microarrays.]] Nat Clin Pract Oncol. 2006 May;3(5):256-68.))((Gallagher RI, Espina V. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25358623|Reverse phase protein arrays: mapping the path towards personalized medicine.]] Mol Diagn Ther. 2014 Dec;18(6):619-30. doi: 10.1007/s40291-014-0122-3.)). Questa tecnologia permette di utilizzare campioni di varia natura: porzioni di tessuto tumorale, liquidi biologici come ad esempio siero o liquido cefalorachidiano e cellule tumorali derivate da pazienti e coltivate in vitro((Locard-Paulet M et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26861043|Phosphoproteomic analysis of interacting tumor and endothelial cells identifies regulatory mechanisms of transendothelial migration.]] Sci Signal. 2016 Feb 9;9(414):ra15. doi: 10.1126/scisignal.aac5820.))((Santacatterina F et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25880557|Quantitative analysis of proteins of metabolism by reverse phase protein microarrays identifies potential biomarkers of rare neuromuscular diseases.]] J Transl Med. 2015 Feb 18;13:65. doi: 10.1186/s12967-015-0424-1.))((Gujral TS et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22945653|Profiling phospho-signaling networks in breast cancer using reverse-phase protein arrays.]] Oncogene. 2013 Jul 18;32(29):3470-6. doi: 10.1038/onc.2012.378. Epub 2012 Sep 3.))((Akbani R et al. [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24871328|A pan-cancer proteomic perspective on The Cancer Genome Atlas.]] Nat Commun. 2014 May 29;5:3887. doi: 10.1038/ncomms4887.)).
-{{:imageplaceholder300x200pt.svg?300 |Fotografia dello strumento}} //Lorem ipsum dolor sit amet//, consectetur adipiscing elit, sed do eiusmod tempor incididunt ut labore et dolore magna aliqua. Ut enim ad minim veniam, quis nostrud exercitation **ullamco laboris** nisi ut aliquip ex ea commodo consequat. __Duis aute irure dolor__ in reprehenderit in voluptate velit esse cillum dolore eu fugiat nulla pariatur. Excepteur sint occaecat cupidatat non proident, sunt in culpa qui officia deserunt mollit anim id est laborum.
+L’unità ha acquisito esperienza specifica in campo oncologico e in particolare:
+  * nello studio degli effetti di inibitori di chinasi sull’organizzazione delle reti di trasduzione del segnale in cellule staminali tumorali;
+  * nella classificazione fosfoproteomica di campioni derivati da pazienti oncologici.
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+Un'applicazione innovativa è il riposizionamento, in diversi ambiti terapeutici, di farmaci approvati studiandone gli effetti sulle reti di trasduzione del segnale.
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+La strumentazione avanzata dell'unità comprende: un microdissettore a laser infrarosso per isolare specifiche porzioni di tessuto, un arrayer robotico per la microdeposizione dei campioni proteici su vetrini ricoperti da nitrocellulosa, un Autostainer per effettuare le immunocolorazioni e l'amplificazione del segnale in modo automatizzato, uno scanner a fluorescenza per digitalizzare i vetrini immunocolorati e una piattaforma software per l'analisi di immagine che consente la quantificazione e la normalizzazione del segnale. <wrap hi>Questa dotazione rende l'unità di RPPA unica in Italia</wrap>. Inoltre, in __{{:aree:proteomica:rppa:pathway_anticorpi-rppa-iss.xlsx|Tabella 1}}__ è riassunto il numero di anticorpi validati per più di 20 vie di trasduzione del segnale per un totale di circa __{{:aree:proteomica:rppa:validated_antibodies-rppa-iss.xlsx|400 anticorpi validati}}__, la maggior parte diretti contro proteine fosforilate o altre modifiche post-traduzionali. Nuovi anticorpi vengono validati, di volta in volta, e aggiunti alla banca a seconda delle diverse esigenze progettuali.
-> Contatto/i di riferimento: [[nome.cognome@iss.it|Nome Cognome]]
+L'unità di RPPA collabora con l'Istituto Nazionale Tumori di Milano, l'Istituto Nazionale Tumori Regina Elena, l'Università degli Studi di Roma "Tor Vergata", l'Università Cattolica del Sacro Cuore e l'Università degli Studi di Palermo.
-> Tel.: **06 4990 9999**
-> Dove siamo: <corpo>/<edificio>, <piano>, <stanza>
+L'unità fornisce eventuale supporto tecnico-scientifico per l'estrazione delle proteine, la scelta mirata degli anticorpi da studiare e l'analisi statistico/bioinformatica dei dati normalizzati.
+\\
+=== Per accedere al servizio è necessario: ===
+  - contattare preliminarmente il [[chi_siamo|personale dell'unità RPPA]];
+  - compilare il modulo online '**[[richiesta|Richiesta Servizio]]**' illustrando brevemente la problematica scientifica, tipologia e numero di campioni, etc.;
+  - verrà quindi fissato un incontro con il personale dell'unità per discutere le modalità di analisi, i costi, la tempistica etc.
+\\
+> Contatto: [[michele.signore@iss.it|Michele Signore]]
+> ☎ **+39 06 4990 4453**
+> Dove siamo: **GB-BS, stanza 7**