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aree:proteomica:ms:start [2020/02/04 18:36] Gianluca Frustagli |
aree:proteomica:ms:start [2023/03/03 21:19] Gianluca Frustagli Aggiornamento per nuovi strumenti (in corso...). |
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| - | {{:aree:proteomica:ms:lab.jpeg?400 |}} L'unità è dotata di due spettrometri di massa ThermoFisher, un **Orbitrap Fusion** e un **LTQ XL Ion Trap** con frammentazione ETD (Electron Transfer Dissociation) supplementare(([[http://www.pnas.org/cgi/content/full/101/26/9528|Peptide and protein sequence analysis by electron transfer dissociation mass spectrometry]])). | + | {{:aree:proteomica:ms:lab.jpeg?400 |}} L'unità è dotata di due Tribrid Orbitrap Fusion, spettrometri di massa ad alta risoluzione. L’architettura tri-ibrida combina tre analizzatori di massa: il quadrupolo, la trappola ionica e l’Orbitrap. Le tecniche di frammentazione impiegate sono multiple: CID (Collision Induced Dissociation), HCD (Higher-energy Collisional Dissociation) e ETD (Electron transfer dissociation) (([[http://www.pnas.org/cgi/content/full/101/26/9528|Peptide and protein sequence analysis by electron transfer dissociation mass spectrometry]])). E’ presente anche una interfaccia FAIMS (field asymmetric-waveform ion-mobility spectrometry). |
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| Questi strumenti, //in linea// con cromatografi nano-capillari, permettono la separazione di miscele peptiche più o meno complesse e la susseguente identificazione delle proteine costituenti attraverso software dedicati (analisi LC-MS/MS). Questa strumentazione è di grande supporto in quei progetti di ricerca biomedica in cui si è interessati all'individuazione e/o caratterizzazione di proteine e del loro livello di espressione. I campioni da analizzare possono essere molteplici: proteine sintetiche, proteine semi-purificate, immuno-precipitazioni, sub-proteomi, proteomi totali. Generalmente, l’analisi LC-MS/MS è preceduta da elettroforesi (PAGE) per una stima qualitativa e quantitativa del campione seguita da digestione in-gel delle proteine. | Questi strumenti, //in linea// con cromatografi nano-capillari, permettono la separazione di miscele peptiche più o meno complesse e la susseguente identificazione delle proteine costituenti attraverso software dedicati (analisi LC-MS/MS). Questa strumentazione è di grande supporto in quei progetti di ricerca biomedica in cui si è interessati all'individuazione e/o caratterizzazione di proteine e del loro livello di espressione. I campioni da analizzare possono essere molteplici: proteine sintetiche, proteine semi-purificate, immuno-precipitazioni, sub-proteomi, proteomi totali. Generalmente, l’analisi LC-MS/MS è preceduta da elettroforesi (PAGE) per una stima qualitativa e quantitativa del campione seguita da digestione in-gel delle proteine. | ||
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| - | > Contatto: [[marta.ponzi@iss.it|Marta Ponzi]] | + | > Contatto: [[serena.camerini@iss.it|Serena Camerini]] |
| - | > ☎ **+39 06 4990 3134** | + | > ☎ **+39 06 4990 3164** |
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