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aree:in_collaborazione:biofab_research:start [2018/10/17 18:13] Gianluca Frustagli |
aree:in_collaborazione:biofab_research:start [2018/10/31 11:30] (versione attuale) Gianluca Frustagli [Prestazioni offerte] Correzione numero telefonico. |
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|---|---|---|---|
| Linea 1: | Linea 1: | ||
| ~~NOTOC~~ | ~~NOTOC~~ | ||
| - | **Area Sequenziamento** | + | **Area NGS** |
| - | ====== Bio-Fab Research ====== | + | ====== Collaborazione con Bio-Fab Research ====== |
| {{:aree:in_collaborazione:biofab_research:biofab_research.png?350 |}} Dal 21/09/2018 l'ISS ha stabilito una collaborazione scientifica con la **[[https://www.biofabresearch.it|Bio-Fab Research]]**. | {{:aree:in_collaborazione:biofab_research:biofab_research.png?350 |}} Dal 21/09/2018 l'ISS ha stabilito una collaborazione scientifica con la **[[https://www.biofabresearch.it|Bio-Fab Research]]**. | ||
| Linea 18: | Linea 18: | ||
| {{ :aree:in_collaborazione:biofab_research:miseq.png?350 }} | {{ :aree:in_collaborazione:biofab_research:miseq.png?350 }} | ||
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| ===== Applicazioni ===== | ===== Applicazioni ===== | ||
| * sequenziamento di piccoli genomi (**plasmidi, mitocondriale, virus, adenovirus, batteri**) fino al sequenziamento di genomi più grandi e complessi (**funghi**). | * sequenziamento di piccoli genomi (**plasmidi, mitocondriale, virus, adenovirus, batteri**) fino al sequenziamento di genomi più grandi e complessi (**funghi**). | ||
| * **Amplicon sequencing**, approccio che permette di analizzare la variazione genetica in specifiche regioni genomiche. Il sequenziamento ultra-profondo dei prodotti PCR consente un'efficiente identificazione e caratterizzazione delle varianti. Questo metodo utilizza sonde oligonucleotidiche progettate per catturare regioni di interesse, successivamente sequenziate con il MiSeq. Questo servizio è completamente __personalizzabile__, potendo ri-sequenziare prodotti di PCR già amplificati (con dimensioni comprese fra 250 e 450 bp) o richiedere la costruzione di un __pannello specifico__ per geni o regioni di interesse sul genoma. | * **Amplicon sequencing**, approccio che permette di analizzare la variazione genetica in specifiche regioni genomiche. Il sequenziamento ultra-profondo dei prodotti PCR consente un'efficiente identificazione e caratterizzazione delle varianti. Questo metodo utilizza sonde oligonucleotidiche progettate per catturare regioni di interesse, successivamente sequenziate con il MiSeq. Questo servizio è completamente __personalizzabile__, potendo ri-sequenziare prodotti di PCR già amplificati (con dimensioni comprese fra 250 e 450 bp) o richiedere la costruzione di un __pannello specifico__ per geni o regioni di interesse sul genoma. | ||
| - | * studi di Metagenomica tramite l'analisi del 16S o dell'ITS, con possibilità di estendere gli studi ad altre regioni d'interesse del ricercatore. | + | * studi di **metagenomica** tramite l'analisi del 16S o dell'ITS, con possibilità di estendere gli studi ad altre regioni d'interesse del ricercatore. |
| ===== Prestazioni offerte ===== | ===== Prestazioni offerte ===== | ||
| - | - Sequenziamento di interi genomi (plasmidi, mitocondriale, adenovirus, virus, batteri, funghi ... fino a 70/100 Mbp); | + | - Sequenziamento di interi genomi (plasmidi, mitocondriale, adenovirus, virus, batteri, funghi... fino a 70/100 Mbp). |
| - Amplicon sequencing. | - Amplicon sequencing. | ||
| - Pannelli custom. | - Pannelli custom. | ||
| - Pannelli inventoried Illumina. | - Pannelli inventoried Illumina. | ||
| - | - Metagenomica 16S o ITS. | + | - Metagenomica 16S o ITS (DNA/rDNA). |
| - Small RNA seq. | - Small RNA seq. | ||
| - | - Servizio di **analisi bioinformatica**, sia sui dati prodotti dal MiSeq che sui dati già a disposizione del ricercatore: questo servizio è completamente **personalizzabile**, con lo sviluppo di pipeline dedicate ad ogni esigenza. | + | - Servizio di **analisi bioinformatica**, sia sui dati prodotti dal MiSeq che sui dati già a disposizione del ricercatore: questo servizio è completamente __personalizzabile__, con lo sviluppo di pipeline dedicate ad ogni esigenza. |
| - | La Bio-Fab offre anche analisi di smallRNA, mRNA, Total RNA ed esomi interi. | + | La Bio-Fab offre anche analisi di smallRNA, mRNA, Total RNA ed esomi interi ed altri **[[altro|servizi per la biologia molecolare]]** (a prezzi convenzionati per i dipendenti ISS). |
| - | <wrap em>Per accedere al servizio è necessario inviare una e-mail illustrando brevemente la problematica scientifica: tipologia di campione (DNA, RNA etc), numero di campioni da sequenziare.</wrap> | + | \\ |
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| + | <wrap em>Per accedere al servizio è necessario inviare una e-mail all'indirizzo [[laboratori@biofabresearch.it]] illustrando brevemente la problematica scientifica: tipologia di campione (DNA, RNA etc), numero di campioni da sequenziare.</wrap> | ||
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| <ifintranet> | <ifintranet> | ||
| - | <wrap info>la seguente informazione sarà visibile solo nell'intranet</wrap> \\ | + | Per consultare il <wrap em>listino in convenzione</wrap> e per comunicazioni accedere all'area riservata della Bio-Fab dedicata all'ISS: |
| - | Per il listino in convenzione e per comunicazioni accedere all'area riservata della Bio-Fab dedicata all'ISS: \\ | + | |
| - | [[https://www.biofabresearch.it/iss/]] \\ | + | > https://www.biofabresearch.it/iss/ |
| - | utente: ISS \\ | + | > user: ISS |
| - | password: @iss2018@ | + | > password: @iss2018@ |
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| + | Per conoscere i dettagli di tutti i servizi, visitare il sito web della Bio-Fab o inviare un'e-mail. | ||
| > Dove siamo: edificio 10, piano B, stanza 6. | > Dove siamo: edificio 10, piano B, stanza 6. | ||
| - | > ☎ +39 4990 3053 | + | > ☎ +39 06 4990 3053 |
| > [[laboratori@biofabresearch.it]] | > [[laboratori@biofabresearch.it]] | ||
| > [[https://www.biofabresearch.it]] | > [[https://www.biofabresearch.it]] | ||
