Differenze

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--- aree:in_collaborazione:biofab_research:start [2018/10/17 16:45]
Gianluca Frustagli [Applicazioni]
+++ aree:in_collaborazione:biofab_research:start [2018/10/31 11:30] (versione attuale)
Gianluca Frustagli [Prestazioni offerte] Correzione numero telefonico.
@@ Linea 1: / Linea 1: @@
-**Area Sequenziamento**
+~~NOTOC~~
-====== Bio-Fab Research ======
+**Area NGS**
+====== Collaborazione con Bio-Fab Research ======
 {{:aree:in_collaborazione:biofab_research:biofab_research.png?350 |}} Dal 21/09/2018 l'ISS ha stabilito una collaborazione scientifica con la **[[https://www.biofabresearch.it|Bio-Fab Research]]**.
@@ Linea 14: / Linea 16: @@
 Questo strumento consente di sequenziare 25 milioni di frammenti in SR e 50 milioni di reads in PE ed  ha un output massimo di 15 Gbp. La tipologia delle corse, in single read (SR) o paired end (PE), va  da 1X75 a 2X300, potendo quindi sequenziare frammenti fino a 600bp.
+{{ :aree:in_collaborazione:biofab_research:miseq.png?350 }}
 ===== Applicazioni =====
@@ Linea 19: / Linea 23: @@
   * sequenziamento di piccoli genomi (**plasmidi, mitocondriale, virus, adenovirus, batteri**) fino al sequenziamento di genomi più grandi e complessi (**funghi**).
   * **Amplicon sequencing**, approccio che permette di analizzare la variazione genetica in specifiche regioni genomiche. Il sequenziamento ultra-profondo dei prodotti PCR consente un'efficiente identificazione e caratterizzazione delle varianti. Questo metodo utilizza sonde oligonucleotidiche progettate per catturare regioni di interesse, successivamente sequenziate con il MiSeq. Questo servizio è completamente __personalizzabile__, potendo ri-sequenziare prodotti di PCR già amplificati (con dimensioni comprese fra 250 e 450 bp) o richiedere la costruzione di un __pannello specifico__ per geni o regioni di interesse sul genoma.
-  * studi di Metagenomica tramite l'analisi del 16S o dell'ITS, con possibilità di estendere gli studi ad altre regioni d'interesse del ricercatore.
+  * studi di **metagenomica** tramite l'analisi del 16S o dell'ITS, con possibilità di estendere gli studi ad altre regioni d'interesse del ricercatore.
 ===== Prestazioni offerte =====
-  - Sequenziamento di interi genomi (plasmidi, mitocondriale, adenovirus, virus, batteri, funghi ... fino a 70/100 Mbp);
+  - Sequenziamento di interi genomi (plasmidi, mitocondriale, adenovirus, virus, batteri, funghi... fino a 70/100 Mbp).
   - Amplicon sequencing.
   - Pannelli custom.
   - Pannelli inventoried Illumina.
-  - Metagenomica 16S o ITS.
+  - Metagenomica 16S o ITS (DNA/rDNA).
   - Small RNA seq.
-  - Servizio di **analisi bioinformatica**, sia sui dati prodotti dal MiSeq che sui dati già a disposizione del ricercatore: questo servizio è completamente **personalizzabile**, con lo sviluppo di pipeline dedicate ad ogni esigenza.
+  - Servizio di **analisi bioinformatica**, sia sui dati prodotti dal MiSeq che sui dati già a disposizione del ricercatore: questo servizio è completamente __personalizzabile__, con lo sviluppo di pipeline dedicate ad ogni esigenza.
+La Bio-Fab offre anche analisi di smallRNA, mRNA, Total RNA ed esomi interi ed altri **[[altro|servizi per la biologia molecolare]]** (a prezzi convenzionati per i dipendenti ISS).
+\\
+<wrap em>Per accedere al servizio è necessario inviare una e-mail all'indirizzo [[laboratori@biofabresearch.it]] illustrando brevemente la problematica scientifica: tipologia di campione (DNA, RNA etc), numero di campioni da sequenziare.</wrap>
+\\
-La Bio-Fab offre anche analisi di smallRNA, mRNA, Total RNA ed esomi interi.
+<ifintranet>
+Per consultare il <wrap em>listino in convenzione</wrap> e per comunicazioni accedere all'area riservata della Bio-Fab dedicata all'ISS:
-Per accedere al servizio è necessario inviare una e-mail all'indirizzo [[laboratori@biofabresearch.it]] illustrando brevemente la problematica scientifica: tipologia di campione (DNA, RNA etc), numero di campioni da sequenziare.
+> https://www.biofabresearch.it/iss/
+> user: ISS
+> password: @iss2018@
+</ifintranet>
-<ifintranet>{{listino.pdf|Listino prezzi e descrizione dettagliata delle prestazioni offerte}}</ifintranet>
+Per conoscere i dettagli di tutti i servizi, visitare il sito web della Bio-Fab o inviare un'e-mail.
+> Dove siamo: edificio 10, piano B, stanza 6.
+> ☎ +39 06 4990 3053
+> [[laboratori@biofabresearch.it]]
+> [[https://www.biofabresearch.it]]