Area

Next Generation Sequencing (NGS)


L'area NGS ha come obiettivo di offrire tecnologie di sequenziamento multipiattaforma (Illumina, Ion Torrent,10X Genomics) all’avanguardia e dati di alta qualità a ricercatori dell'ISS e di istituzioni esterne, sia accademiche che private.

Il personale esperto dell’area NGS accompagna il ricercatore in tutte le fasi: dalla progettazione sperimentale al dato finale per applicazioni quali il sequenziamento microbico (SWGS, sia re-sequencing che de novo, 16S, ITS, RNAseq), sequenziamento mirato del DNA e dell’RNA basato sulla tecnologia ampliseq (transcrittoma umano e murino, pannelli specifici), esoma, RNA totale, microRNA, LncRNA, amplicon sequencing, ChIP-seq.

L’area ha esperienza di trascrittomica a singola cellula e di trascrittomica spaziale sia da campioni freschi che fissati. La facility NGS collabora con i ricercatori, sia interni all’ISS che esterni, per l’implementazione di nuove applicazioni.

La facility inoltre supporta i ricercatori nella preparazione di domande di finanziamento di progetti che implichino Next Generation Sequencing e single cell OMICs.

Per accedere al servizio è necessario:

  1. Contattare preliminarmente il personale dell'area NGS;
  2. compilare il modulo online 'Richiesta Servizio' illustrando brevemente la problematica scientifica, tipologia di campione (DNA, RNA etc.), numero di campioni da sequenziare etc.;
  3. verrà quindi fissato un incontro con il personale dell'area per discutere le modalità di analisi, i costi, la tempistica etc.


Referente: Manuela Marra
+39 06 4990 3051