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aree:ngs:prestazioni [2017/11/05 23:53]
Gianluca Frustagli [Table]
— (versione attuale)
Linea 1: Linea 1:
-**Area Sequenziamento** 
  
-====== Prestazioni offerte ====== 
- 
-  - **analisi di genomi di piccole dimensioni**;​ 
-  - **targeted sequencing da DNA**: sequenziamento di pannelli di geni ("​inventoried"​ o "​custom"​) correlati a specifiche malattie mendeliane o a determinati tipi di patologie; 
-  - **targeted sequencing da RNA**: sequenziamento di target specifici o gene expression; 
-  - **ChIP-Seq** (Chromatin Immunoprecipitation Sequencing):​ per mappare sul genoma i punti di legame di fattori di trascrizione o altre proteine associate alla cromatina. 
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-\\ 
- 
-===== Prezzario ===== 
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-^  Esempio di tipologia di campione ​                                                                                ​^ ​ Prezzo indicativo ((IVA esclusa a carico del richiedente;​ da pagare in kind calcolato su frammenti di DNA di 400 bp con un coverage di 50X))  ^ 
-| genoma plasmidico (circa 100 kbp) library inclusa ((Il costo di produzione della library è di 65 € a campione.)) ​ |  120 €                                                                                                                                         | 
-| genoma batterico (circa 3 Mbp) library inclusa ((Il costo di produzione della library è di 65 € a campione.)) ​    ​| ​ 210 €                                                                                                                                         | 
-| genoma batterico (circa 5 Mbp) library inclusa ((Il costo di produzione della library è di 65 € a campione.)) ​    ​| ​ 335 €                                                                                                                                         | 
-| frammento da 400 bp                                                                                               ​| ​ 0,02 €                                                                                                                                        | 
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-==== Per accedere al servizio è necessario: ==== 
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-  - Contattare preliminarmente il personale dell'​area sequenziamento ([[fiorella.ciaffoni@iss.it|Fiorella Ciaffoni]], [[manuela.marra@iss.it|Manuela Marra]], [[caterina.veroni@iss.it|Caterina Veroni]]); 
-  - compilare il modulo online '​**[[aree:​ngs:​richiesta|Richiesta servizio]]**'​ illustrando brevemente la problematica scientifica:​ tipologia di campione (DNA, RNA etc.), numero di campioni da sequenziare etc.; 
-  - verrà quindi fissato un incontro con il personale dell'​area per discutere le modalità di analisi, i costi, la tempistica etc.